e-SCLS 講習会コンテンツ
SCLS計算機システムを利用した講習会やSCLSの研究成果、SCLSにおいてスーパーコンピュータ「京」で開発されたソフトウェア普及のための講習会の講義の動画教材をご紹介します。
講習会コンテンツ一覧
AICS公開ソフト講習会第4回「GENESIS」講義 |
ベイジアンネットワークを用いた遺伝子ネットワークの推定と解析 |
だれにでもわかる拡張サンプリングシミュレーション |
AICS公開ソフト講習会第4回「GENESIS」講義
講師 | 理研、計算科学研究機構(AICS) 粒子系生物物理研究チーム 小林千草 |
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内容 | 「GENESIS」講義 | |
公開日 | 2014年6月17日 | |
構成 | ・生体分子の分子動力学法 ・GENESISの特徴 |
(00:25:43) |
ベイジアンネットワークを用いた遺伝子ネットワークの推定と解析
講師 | 株式会社セルイノベーター 研究開発部 部長 土井 淳 |
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内容 | SiGN-BN講習 (講演資料) | |
公開日 | 2014年3月18日 | |
構成 | 1. マネーボール:統計学の応用 | (00:07:31) |
2. 遺伝子発現とベイジアンネットワーク | (00:11:27) |
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補論 簡単な数式で紹介するベイジアンネットワーク | (00:08:30) |
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3. 遺伝子ネットワーク | (00:19:38) |
だれにでもわかる拡張サンプリングシミュレーション
ー長時間分子動力学シミュレーションへの挑戦ー
講師 | 理化学研究所 HPCI計算生命科学推進プログラム 副プログラムディレクター 横浜市立大学 木寺詔紀 |
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内容 | 拡張サンプリングシミュレーションの基礎解説 ソフトウェアμ2libの紹介 (講演資料) |
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公開日 | 2014年3月3日 | |
構成 |
1. タンパク質の計算生命科学と分子動力学計算 2.「長時間分子動力学シミュレーションへの挑戦」二つの意味 |
(00:18:42) |
3.拡張サンプリングシミュレーション |
(00:27:09) |
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質疑応答 1問目~9問目 |
(00:15:07) |
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4. 我々の考え方とその方法ーμ2lib 拡張サンプリング |
(00:14:11) |
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質疑応答 10問目~21問目 |
(00:26:19) |